Las cubas con doble compartimento ofrecen muchas maneras de variar y mejorar el desarrollo de la cromatografía.
Permite reducir el consumo de solvente, y el subsecuente problema de su desechado.
Para la cuba de 20 x 20 cm son suficientes 20 ml de solvente, la de 20 x 10 cm son suficientes 10 ml y para la de 10 x 10 cm, 5 ml de solvente.
Permite establecer pre-condiciones reproducibles en la placa situando el solvente en el compartimento opuesto, permitiendo la absorción del vapor. Este procedimiento puede realizarse mediante cualquier solvente y por el tiempo deseado.